الصخور النارية
يوجد بالمتحف عينات تمثل الصخور النارية المختلفة ( جوفية - تحت سطحية – البركانية ) والتي يبلغ عددها 216 عينة ممثلة لصخور مصر وبعض دول العالم ومقسمة إلى مجموعات مختلفة.
الصخور المتحولة
إضافه إلى نماذج الصخور النارية فإنه يوجد أنواع واللافقاريات أثناء الزمن الجيولوجي مختلفة من الصخور المتحولة عددها حوالى 199 عينة والتي تمثل أنواع التحول المختلفة.
الصخور الرسوبية
يضم المتحف 350 عينة مجمعة من مصر وألمانيا وروسيا وأمريكا ممثلة لأنواع الصخور الرسوبية المختلفة ذات القيمة الاقتصادية الهامة إلى جانب الكثير من الأشكال الأولية المميزة لها .