يسعى المستشفى البيطري التعليمي كامتداد لكلية الطب البيطري جامعة اسيوط الى التميز في مجال العلوم الطبية البيطرية الاكلينيكية محليا واقليميا وعالميا والارتقاء بالعملية التعليمية وتدريب الطلاب والخريجين من أطباء بيطريين والارتقاء بالبحث العلمي وتطويره ليشمل كافة المجالات التي تعنى بالمشاكل الحقلية مع تقديم الحلول المناسبة والانخراط في خدمة المجتمع وتنمية البيئة المحيطة والتي تسهم في تنمية الثروة الحيوانية.
تساهم المستشفى البيطري التعليمي بإمداد سوق العمل بالأطباء البيطريين الأكفاء من خلال التدريب المكثف لإكسابهم المهارات الفنية اللازمة للمنافسة في سوق العمل، والاهتمام بالبحث العلمي في مجال الطب البيطري الاكلينيكي والتعاون مع التخصصات العلمية الأخرى وذلك لخدمة المجتمع واحتياجاته.