Skip to main content

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and Connexin-26 gene sequence analysis of non-syndromic heredofamilial hearing loss.

Research Abstract
تم الحصول علي عينات دم من عدد من المرضي وذويهم الاصحاء كلما أمكن بعد معرفة التاريخ المرضي لكل فرد واجراء الفحص الاكلينيكي للاذن والانف والحنجرة وكذا الاختبارات السمعية. وجري أستخلاص الحامض النووي DNA من دم خمسة عشر مريضا وسبعة من ذويهم الاصحاء ، وأجري التحليل بأستخدام طريقة RAPD لمعرفة الطرز الجينية المختلفة لهؤلاء الافراد. كما تم تحديد تتابع القواعد للتحري عن وجود طفرات لجين (كونكسين 26 ) لأحد عشر مريضا. أظهرت نتائج تحديد تتابع القواعد للجزئ الوراثي وجود طفرة فقدان القاعدة G35 في مريض واحد (بنسبة تقرب من 10%). وأمكن بأستخدام طريقة RAPD تقسيم المرضي إلي ثلاث مجموعات مما يرجح إحتمال وجود ثلاث طفرات تسبب ضعف السمع غير المتلازم في صعيد مصر. وأظهر التحليل وجود أربع حزم ظاهرة ببعض عينات المرضي غابت في أقاربهم الاصحاء ، وكذا وجود أربع حزم في الأقارب الأصحاء لم توجد في المرضي. وتوضح الدراسة إمكانية إستخدام طريقة RAPD في التشخيص المبكر لمرضي ضعف السمع الوراثي غير المتلازم.
Research Authors
• محمد مصطفي سعد .
• نبيل عبد الفتاح محمد .
• جمال إبراهيم أحمد محمد .
• حسام أحمد محمد .
Research Journal
Egyptian Journal of Genetics and Cytology,
Research Pages
219-225
Research Publisher
NULL
Research Rank
1
Research Vol
36
Research Website
NULL
Research Year
2007

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and Connexin-26 gene sequence analysis of non-syndromic heredofamilial hearing loss.

Research Abstract
تم الحصول علي عينات دم من عدد من المرضي وذويهم الاصحاء كلما أمكن بعد معرفة التاريخ المرضي لكل فرد واجراء الفحص الاكلينيكي للاذن والانف والحنجرة وكذا الاختبارات السمعية. وجري أستخلاص الحامض النووي DNA من دم خمسة عشر مريضا وسبعة من ذويهم الاصحاء ، وأجري التحليل بأستخدام طريقة RAPD لمعرفة الطرز الجينية المختلفة لهؤلاء الافراد. كما تم تحديد تتابع القواعد للتحري عن وجود طفرات لجين (كونكسين 26 ) لأحد عشر مريضا. أظهرت نتائج تحديد تتابع القواعد للجزئ الوراثي وجود طفرة فقدان القاعدة G35 في مريض واحد (بنسبة تقرب من 10%). وأمكن بأستخدام طريقة RAPD تقسيم المرضي إلي ثلاث مجموعات مما يرجح إحتمال وجود ثلاث طفرات تسبب ضعف السمع غير المتلازم في صعيد مصر. وأظهر التحليل وجود أربع حزم ظاهرة ببعض عينات المرضي غابت في أقاربهم الاصحاء ، وكذا وجود أربع حزم في الأقارب الأصحاء لم توجد في المرضي. وتوضح الدراسة إمكانية إستخدام طريقة RAPD في التشخيص المبكر لمرضي ضعف السمع الوراثي غير المتلازم.
Research Authors
• محمد مصطفي سعد .
• نبيل عبد الفتاح محمد .
• جمال إبراهيم أحمد محمد .
• حسام أحمد محمد .
Research Journal
Egyptian Journal of Genetics and Cytology,
Research Pages
219-225
Research Publisher
NULL
Research Rank
1
Research Vol
36
Research Website
NULL
Research Year
2007

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and Connexin-26 gene sequence analysis of non-syndromic heredofamilial hearing loss.

Research Abstract
تم الحصول علي عينات دم من عدد من المرضي وذويهم الاصحاء كلما أمكن بعد معرفة التاريخ المرضي لكل فرد واجراء الفحص الاكلينيكي للاذن والانف والحنجرة وكذا الاختبارات السمعية. وجري أستخلاص الحامض النووي DNA من دم خمسة عشر مريضا وسبعة من ذويهم الاصحاء ، وأجري التحليل بأستخدام طريقة RAPD لمعرفة الطرز الجينية المختلفة لهؤلاء الافراد. كما تم تحديد تتابع القواعد للتحري عن وجود طفرات لجين (كونكسين 26 ) لأحد عشر مريضا. أظهرت نتائج تحديد تتابع القواعد للجزئ الوراثي وجود طفرة فقدان القاعدة G35 في مريض واحد (بنسبة تقرب من 10%). وأمكن بأستخدام طريقة RAPD تقسيم المرضي إلي ثلاث مجموعات مما يرجح إحتمال وجود ثلاث طفرات تسبب ضعف السمع غير المتلازم في صعيد مصر. وأظهر التحليل وجود أربع حزم ظاهرة ببعض عينات المرضي غابت في أقاربهم الاصحاء ، وكذا وجود أربع حزم في الأقارب الأصحاء لم توجد في المرضي. وتوضح الدراسة إمكانية إستخدام طريقة RAPD في التشخيص المبكر لمرضي ضعف السمع الوراثي غير المتلازم.
Research Authors
• محمد مصطفي سعد .
• نبيل عبد الفتاح محمد .
• جمال إبراهيم أحمد محمد .
• حسام أحمد محمد .
Research Department
Research Journal
Egyptian Journal of Genetics and Cytology,
Research Pages
219-225
Research Publisher
NULL
Research Rank
1
Research Vol
36
Research Website
NULL
Research Year
2007

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and Connexin-26 gene sequence analysis of non-syndromic heredofamilial hearing loss.

Research Abstract
تم الحصول علي عينات دم من عدد من المرضي وذويهم الاصحاء كلما أمكن بعد معرفة التاريخ المرضي لكل فرد واجراء الفحص الاكلينيكي للاذن والانف والحنجرة وكذا الاختبارات السمعية. وجري أستخلاص الحامض النووي DNA من دم خمسة عشر مريضا وسبعة من ذويهم الاصحاء ، وأجري التحليل بأستخدام طريقة RAPD لمعرفة الطرز الجينية المختلفة لهؤلاء الافراد. كما تم تحديد تتابع القواعد للتحري عن وجود طفرات لجين (كونكسين 26 ) لأحد عشر مريضا. أظهرت نتائج تحديد تتابع القواعد للجزئ الوراثي وجود طفرة فقدان القاعدة G35 في مريض واحد (بنسبة تقرب من 10%). وأمكن بأستخدام طريقة RAPD تقسيم المرضي إلي ثلاث مجموعات مما يرجح إحتمال وجود ثلاث طفرات تسبب ضعف السمع غير المتلازم في صعيد مصر. وأظهر التحليل وجود أربع حزم ظاهرة ببعض عينات المرضي غابت في أقاربهم الاصحاء ، وكذا وجود أربع حزم في الأقارب الأصحاء لم توجد في المرضي. وتوضح الدراسة إمكانية إستخدام طريقة RAPD في التشخيص المبكر لمرضي ضعف السمع الوراثي غير المتلازم.
Research Authors
• محمد مصطفي سعد .
• نبيل عبد الفتاح محمد .
• جمال إبراهيم أحمد محمد .
• حسام أحمد محمد .
Research Department
Research Journal
Egyptian Journal of Genetics and Cytology,
Research Member
Research Pages
219-225
Research Publisher
NULL
Research Rank
1
Research Vol
36
Research Website
NULL
Research Year
2007

Evolution of chemical defense traits in the Leguminosae: mapping of distribution patterns of secondary metabolites on a molecular phylogeny inferred from nucleotide sequences of the rbcL gene.

Research Abstract
أنواع عديدة من القلويات والاحماض الامينية الغير بروتينية والامينات ونواتج ميتابوليزمية ثانوية عديدة تم وصفها في العائلة البقولية. كذلك تم تحديد تتابع النيكليوتيدات لجين الـ rbcL لاكثر من 450 نبات بقولي أستخدمت للاستدلال العرقي لهذه العائلة. وتم إنتخاب أكثر من 150 جنس تغطي معظم قبائل العائلة البقولية وتم ربط المعلومات المتحصل عليها من التحليلات الجزيئية والكيماوية معا للحصول علي أشجار للاستدلال العرقي توضح توزيع المواد الكيماوية ونواتج الميتابوليزم الثانوية في هذه العائلة. أظهرة النتائج أن مجموعات خاصة من نواتج الميتابوليزم الثانوية توجد في أنواع أو أجناس ذات صلة عرقية ، مثل توزيع قلويات الكوانوليزيدين تكون محددة بجنس الجينستويد بينما الاحماض الامينية الغير بروتينية توجد في عديد من الاجناس. في بعض الحالات ، الافرع وحيدة الاصل تشترك في أحد الكيماويات الدفاعية مما يجعلها تستخدم كميزة تقسيمية وهذا لا يحدث في بعض المواد الاخري حيث أن الميزة التقسيمية يجب أن توجد في كل أعضاء الفرع وحيد الاصل. في العديد من الحالات ، فقد مادة دفاعية خاصة في أحد الاعضاء لجنس وحيد الاصل يستبدل بأخر مثل قلويات بيروليزيدين بدلا من قلويات كوينوليزيدين في جنس كلوتاروليا. كما أظهرت النتائج أيضا أن نواتج الميتابوليزم الثانوية تلعب دورا حيويا كمكونات دفاعية ووجودها يعكس بوضوح التأقلم والاستراتيجيات الخاصة للحياة مما يؤيد أن القوي الانتخابية تنشط الجينات الخاصة بهذه النواتج الميتابوليزمية في أحد الانواع بينما تغلقها في أنواع أخري. لهذا ، مقارنة توزيع نواتج الميتابوليزم الثانوية في النباتات وعلاقاتها التطورية العرقية تعطي معلومات عن التطور وأستراتيجيات الحياة.
Research Authors
M. Wink and Gamal I.A. Mohamed
Research Department
Research Journal
Biochemical Systematics and Ecology (2003) .
Research Member
Research Pages
897-917
Research Publisher
NULL
Research Rank
1
Research Vol
31 (1)
Research Website
NULL
Research Year
2003

GENETIC ANALYSIS OF SOME MORPHOLOGICAL TRAITS OF EGYPTIAN COTTON (Gossypium barbadense L.) UNDER DIFFERENT ENVIRONMENTS

Research Abstract
Abstract: A half-diallel set of crosses was established among six local cultivars of cotton namely Giza-88, Giza-90, Giza-87, Giza-89, Giza-91 and Giza-83 in order to estimate the genetic parameters of agro-physiological traits under two contrasting environments of a clay-fertile soil and a sandy-calcareous infertile soil. The results revealed that the additive and non-additive gene effects were involved in the control of the studied traits in both environments. Most of the variation was attributed to the non –additive gene. Drought stress reverse the gene effects controlling the plant height and number of opened boll under favorable environment, whereas the additive gene effects were more important in favorable conditions but under stress the dominant effects of the genes were more important. The Wr/Vr analysis revealed that over-dominance was operating for the F1 generation and partial dominance was detected for the F2 generation under the two environments. The order of the dominance of the cultivars Giza-87 and Giza-89 were reversed under drought. The genetic parameters indicating non-equal distribution of dominant and recessive alleles among the six parents analyzed. Narrow-sense heritability values were much smaller relatively to broad-sense heritability in the two environments except for the plant height indicating that the additive component was smaller than the other components of variance.
Research Authors
Gamal I.A. Mohamed*, S.H.M. Abd-El-Halem** and E.M.A. Ibrahim*
Research Department
Research Journal
Assiut J. of Agric. Sci.,
Research Member
Ebeid Mohamed Ahmed Ibrahim
Research Pages
1-16
Research Publisher
Fuculty of Agriculture
Research Rank
2
Research Vol
40 (1)
Research Website
www.Assiut J. Agric. Sci.,
Research Year
2009

GENETIC ANALYSIS OF SOME MORPHOLOGICAL TRAITS OF EGYPTIAN COTTON (Gossypium barbadense L.) UNDER DIFFERENT ENVIRONMENTS

Research Abstract
Abstract: A half-diallel set of crosses was established among six local cultivars of cotton namely Giza-88, Giza-90, Giza-87, Giza-89, Giza-91 and Giza-83 in order to estimate the genetic parameters of agro-physiological traits under two contrasting environments of a clay-fertile soil and a sandy-calcareous infertile soil. The results revealed that the additive and non-additive gene effects were involved in the control of the studied traits in both environments. Most of the variation was attributed to the non –additive gene. Drought stress reverse the gene effects controlling the plant height and number of opened boll under favorable environment, whereas the additive gene effects were more important in favorable conditions but under stress the dominant effects of the genes were more important. The Wr/Vr analysis revealed that over-dominance was operating for the F1 generation and partial dominance was detected for the F2 generation under the two environments. The order of the dominance of the cultivars Giza-87 and Giza-89 were reversed under drought. The genetic parameters indicating non-equal distribution of dominant and recessive alleles among the six parents analyzed. Narrow-sense heritability values were much smaller relatively to broad-sense heritability in the two environments except for the plant height indicating that the additive component was smaller than the other components of variance.
Research Authors
Gamal I.A. Mohamed*, S.H.M. Abd-El-Halem** and E.M.A. Ibrahim*
Research Department
Research Journal
Assiut J. of Agric. Sci.,
Research Member
Research Pages
1-16
Research Publisher
Fuculty of Agriculture
Research Rank
2
Research Vol
40 (1)
Research Website
www.Assiut J. Agric. Sci.,
Research Year
2009

Evaluation of some aqueous plant extracts as inhibitors of egg hatch in root-knot nematode Meloidogyne javanica

Research Abstract
ABSTRACT Root-knot nematodes are one of the major limiting factors affecting plant growth and yield. Currently, synthetic pesticides are principle means used in integrated management to the nematodes due to its impact on reduction of environmental pollution and preserve the natural equilibrium of the components of the ecosystem In this framework has been defined many plant species that have significantly effect on nematodes In this work in vitro a potential of aqueous extracts from Neem (Azadirachta indica), Jatropha (Jatropha curcas), Henna (Lawsonia inermis) and Fresh peel of sweet orange (Citrus sinensis) was determine in limiting the hatch of the root-knot nematode, Meloidogyne javanica eggs with four concentrations of aqueous extracts (25, 50, 75 and 100%) in three time of applied. All the extracts reduced the hatching of eggs whereas the most reduction occurred in A. indica, followed by J. gossypifolia as very good inhibitors of egg hatch of M. javanica then L. inermis and C. sinensis.
Research Authors
Atef. M. El-Sagheer1 and Gamal, I.A. Mohamed2
Research Department
Research Journal
The 7th Int. Conf. for Develop. and the Env. in the Arab world
Research Member
Research Pages
11-15
Research Publisher
Assiut University Center for Environmental Studies-Egypt
Research Rank
3
Research Vol
NULL
Research Website
www.Assiut Uni. Cen. for Envir. St.-Egypt
Research Year
2014

Authentication of Euphorbia peplus L. family Euphorbiaceae growing in Egypt using Finger Printing

Research Abstract
Abstract RAPD-PCR was performed using six random primers to identify the genetic diversity among six plant samples belong to two genera (Euphorbia and Ricinus). The dendrogram, based on genetic distance, depict the relationship among the investigated plant samples, separate clearly the six samples. The closest relationship was observed between E. geniculata and E. aphylla; and E. pulcherrima and E. peplus, while this relationship was quite separated between these four samples and the other two samples E. cactus and R. communis. Fragments generated by the six primers show a polymorphism ratio of 88.9%. Bands 3500 and 750 bp generated by primer OP-Z13, and also bands 2000, 1500, 1400, 1200, 1000, 720 and 550 bp generated by primer OP-A09 existing only in the plant samples of E. geniculata and E. aphylla, which suggest that these bands can be used as a positive molecular marker to identify these plant samples. Bands 2500, 1720, 1650, 1300, 950 and 250 bp generated by primer OP-A09, and band 1200 bp generated by primer OP-A20 and band 350 bp generated by primer OP-Z19 and band 250 bp generated by primer OP-Z17 were common in all plant samples of family Euphorbiaceae. Moreover, band 430 bp generated by primer OP-Z17 was characterized for Ricinus communis and absent in other plants of genus Euphorbia. Also, band 2700 bp generated by primer OP-A20 and band 210 bp generated by primer OP-Z19 existing only in Euphorbia peplus. This study highlights the usefulness of RAPD assay for determining genetic variation in different plant genera and for estimating genetic distances between different plant samples. Moreover, knowledge of genetic distance among genera and species, and genetic diversity/structure within genera could be useful for conservation of genetic resources. Data presented here are the first report in Egypt of genetic variation inside genera Euphorbia and Ricinus described at the molecular level. We consider this work as a first step in molecular characterization of genera Euphorbia and Ricinus, thus, it is recommended to extend the panel of samples and primers in the future.
Research Authors
Gamal I.A. Mohamed1; Ahmed Mohamed Zaher2; Ahmed A. Ali2;
Hanaa Mohamed Saeyd2 and Sabrin R. Mohamed2
Research Journal
Assiut J. Agric. Sci.,
Research Pages
NULL
Research Publisher
Faculty of Agriculture
Research Rank
2
Research Vol
NULL
Research Website
www.Assiut J. Agric. Sci.,
Research Year
2016

Authentication of Euphorbia peplus L. family Euphorbiaceae growing in Egypt using Finger Printing

Research Abstract
Abstract RAPD-PCR was performed using six random primers to identify the genetic diversity among six plant samples belong to two genera (Euphorbia and Ricinus). The dendrogram, based on genetic distance, depict the relationship among the investigated plant samples, separate clearly the six samples. The closest relationship was observed between E. geniculata and E. aphylla; and E. pulcherrima and E. peplus, while this relationship was quite separated between these four samples and the other two samples E. cactus and R. communis. Fragments generated by the six primers show a polymorphism ratio of 88.9%. Bands 3500 and 750 bp generated by primer OP-Z13, and also bands 2000, 1500, 1400, 1200, 1000, 720 and 550 bp generated by primer OP-A09 existing only in the plant samples of E. geniculata and E. aphylla, which suggest that these bands can be used as a positive molecular marker to identify these plant samples. Bands 2500, 1720, 1650, 1300, 950 and 250 bp generated by primer OP-A09, and band 1200 bp generated by primer OP-A20 and band 350 bp generated by primer OP-Z19 and band 250 bp generated by primer OP-Z17 were common in all plant samples of family Euphorbiaceae. Moreover, band 430 bp generated by primer OP-Z17 was characterized for Ricinus communis and absent in other plants of genus Euphorbia. Also, band 2700 bp generated by primer OP-A20 and band 210 bp generated by primer OP-Z19 existing only in Euphorbia peplus. This study highlights the usefulness of RAPD assay for determining genetic variation in different plant genera and for estimating genetic distances between different plant samples. Moreover, knowledge of genetic distance among genera and species, and genetic diversity/structure within genera could be useful for conservation of genetic resources. Data presented here are the first report in Egypt of genetic variation inside genera Euphorbia and Ricinus described at the molecular level. We consider this work as a first step in molecular characterization of genera Euphorbia and Ricinus, thus, it is recommended to extend the panel of samples and primers in the future.
Research Authors
Gamal I.A. Mohamed1; Ahmed Mohamed Zaher2; Ahmed A. Ali2;
Hanaa Mohamed Saeyd2 and Sabrin R. Mohamed2
Research Journal
Assiut J. Agric. Sci.,
Research Pages
NULL
Research Publisher
Faculty of Agriculture
Research Rank
2
Research Vol
NULL
Research Website
www.Assiut J. Agric. Sci.,
Research Year
2016
Subscribe to